AVALIAÇÃO GENÉTICA DE BACTÉRIAS ENDOFÍTICAS OBTIDAS DE ÁREAS DA REGIÃO OESTE DO ESTADO DO PARANÁ SOB DIFERENTES MANEJOS DE CULTIVO

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Aluno de Iniciação Científica: Everton Geraldo Capote Ferreira (IC-Voluntária)

Curso: Tecnologia em Biotecnologia - Palotina (N)

Orientador: Luciana Grange

Co-Orientador: Marco Antonio Bacellar Barreiros

Colaborador: Walkyria Neiverth, André Barazetti

Departamento: Genética

Setor: Campus Palotina

Área de Conhecimento: 20202008


RESUMO

As rizobactérias endofíticas possibilitam redução nos impactos ambientais e nos custos de produção na agricultura, devido aos seus potenciais biotecnológicos para a fixação biológica de nitrogênio (FBN) e utilização como promotoras de crescimento vegetal (BPCV). Sendo assim, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a diversidade genética de indivíduos endofíticos isolados de distintos solos provenientes de nove manejos agrícolas diferentes entre si, mais uma área de mata ciliar, através de técnicas moleculares. O DNA genômico das estirpes foi extraído de colônias puras, obtendo-se um total de 323 amostras. A caracterização genética de 269 isolados mais sete estirpes padrões foi realizada pela reação de rep-PCR com "primer" específico BOX verificando um total de 25 agrupamentos. Destes, foram selecionadas 93 estirpes e estas foram submetidas à reação de PCR para o gene que codifica a região 16S rRNA a fim de serem analisados, utilizando o programa BioNumerics (Applied Mathematics, Bélgica), quanto ao polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) com diferentes enzimas de restrição (Hae III, Afa I, Hha I, Hinf I, Hap). Como etapa subsequente foram selecionados a partir dos dendrogramas os 31 indivíduos mais polimórficos para o sequenciamento parcial do gene 16S rRNA. Os produtos de PCR do gene ribossomal 16S foram purificados com o kit "PureLink" (Invitrogen™) de acordo com as instruções do fabricante. Em seguida os produtos purificados foram submetidos à reação de sequenciamento pelo método de Sanger, com o uso do "kit" DYEnamic™ET dye terminator cycle sequencing (MegaBACE™). As sequências obtidas foram analisadas com o auxílio dos programas phredPhrap versão 0,990722 (1993-2000) e examinadas manualmente. As seqüências de nucleotídeos geradas foram comparadas com outras sequências previamente depositadas no banco de dados internacional "GenBank" do National Center for Biotechonology Information (NCBI), usando a ferramenta BLASTN. Foram identificados os gêneros: Pantoea, Enterobacter. Microbacterium, Delftia, Agrobacterium. Sendo assim, foi possível observar que não houve relação direta das estirpes com o manejo de cultivo nem com o tipo de solo, o que vem revelando não só a alta diversidade genética dos micro-organimos obtidos das diferentes áreas, como também a alta adaptabilidade destes isolados frente às condições permitidas pelos diferentes sistemas agrícolas.

Palavras-chave: Rizobactérias, Manejos de solo, FBN