BANCO DE DADOS E SÍTIO NA INTERNET DO LABORATÓRIO DE GENÉTICA MOLECULAR HUMANA

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Aluno de Iniciação Científica: Andressa Eloisa Valengo (PIBIC/CNPq)

Curso: Informatica Biomédica (TN)

Orientador: Maria Luiza Petzl-Erler

Co-Orientador: Pablo Sandro Carvalho Santos

Colaborador: Liana Alves de Oliveira

Departamento: Genética

Setor: Setor de Ciências Biológicas

Área de Conhecimento: 20200005


RESUMO

O objetivo deste trabalho é estruturar o banco de dados (BD) do Laboratório de Genética Molecular Humana (LGMH), organizar a inclusão de dados, incluir novos dados e realizar o levantamento e sumarização destes dados. Foram realizadas alterações na estrutura do BD, com o intuito de resolver problemas encontrados, bem como a inclusão/atualização de dados dos registros. Procurou-se testar a funcionalidade das alterações realizadas, para saber da necessidade de mantê-las ou modificá-las. No decorrer do projeto, outros integrantes do grupo de pesquisa puderam especificar mais claramente as suas necessidades em relação ao BD, o que tornou possível a melhora da estrutura e das funcionalidades do BD. Além do armazenamento adequado da informação no laboratório, é importante tornar acessíveis ao público em geral os resultados das pesquisas realizadas, por isso, continuamos a desenvolver o site do LGMH. Fizemos alterações no código fonte para torná-lo mais compatível com os diferentes navegadores, inclusive de dispositivos móveis. Uma versão em inglês está também sendo preparada. Paralelamente a isto, iniciamos um novo projeto que se enquadra nas atividades complementares, intitulado "Pênfigo e a Hipótese do Mosquito: Análise in silico", no qual verificamos a similaridade de sequências entre as proteínas salivares do Simulium nigrimanum e as desmogleínas. Isto se justifica, pois uma das hipóteses de fator ambiental na patogênese de Pênfigo Foliáceo Endêmico (PFE), uma doença autoimune de pele, envolve mosquitos da família simuliidae: Lombardi et al. (1992) relacionaram a distribuição geográfica dos insetos com PFE. Foi sugerido que na saliva desses mosquitos exista algum componente que estimule uma resposta imune e que tenha uma reação cruzada com proteínas dos desmossomos, tendo como alvo principal a desmogleína 1 (DSG1), podendo desencadear a autoimunidade. Para tal comparação, foi desenvolvido um código em linguagem C. Após analisarmos os resultados obtidos, os valores mais significativos, quanto à identidade de sequência, foram entre a DSG1 e as proteínas salivares do Simulium nigrimanum, em comparação com as demais desmogleínas.

Palavras-chave: Banco de Dados, Pênfigo, Divulgação Científica